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이런저런 주제로 얘기하는 나/연구원의 과학,실험얘기25

[실험] quantitative PCR, Real time PCR(qPCR, RT-PCR) 원리와 분석방법은?? 오늘 뽑아놓은 cDNA 로 quantitative PCR , qPCR 을 돌렸다!!! 내 cell에 있는 RNA, 그러니까 protein으로 발현하기 전 RNA를 extraction했고, 이걸로 cDNA를 합성한 후에 정량값을 비교하기 위해 qPCR을 진행했다! 근데 사실 나는 qPCR, 그러니까 정량값을 계산해본적이 없다. 그냥 cDNA를 합성해서 gel을 내려서 그 발광도만 육안평가하고 내가 디자인 한 PCR product대로 사이즈가 잘 나오는지를 확인해보았기 때문에 RTPCR을 평가하고 분석하는 방법은 잘 모른다. 이 기회에 한번 공부를 해보기로 했다!!!!! qPCR은 quantitative Real time PCR (qRT-PCR) 또는 real time PCR이라고도 불린다. 이 실험 기법은.. 2020. 11. 14.
[이론] 세포주기 (cell cycle) 에 대해서 알아보자!! 진핵세포의 세포주기는 G1, S, G2, M기 이렇게 총 4가지의 단계로 구분되는데, 3가지 단계인 G1, S, G2기를 통틀어서 간기(interphase)라고 하며, M기는 체세포분열 시에는 염색분체를 나누고 (karyokinesis) 세포질을 분할하여 두 개의 딸 세포에 분배하게 된다. G0기(또는 휴식기)는 세포주기를 벗어나 쉬는 상태로 양분 부족 등 세포 증식을 제한하는 조건에 있는 세포, 사멸하고 있는 세포, 분화가 끝난 세포 등을 말한다. 분열이 이루어지지 않는 분열정지기이지만 실제로 정지한 것은 아니다. 그 세포의 종류에 따라 신경전도, 특정 단백질 분비, 병원균에 대한 공격 등의 일을 수행하고 있다. 분화 후에 다시 세포주기를 이루지 못하고 계속 주어진 기능을 충실하다가 사멸하는 세포들도 .. 2020. 10. 16.
[실험] Apoptosis assay - In situ Direct DNA fragmentation assay (TUNEL assay) 인체의 정상조직은 세포증식과 세포 사멸 사이의 균형으로 항상성을 유지하고 있고 다양한 원인에 의하여 세포 증식이 활성화되거나 세포사가 감소하면 세포의 수가 비정상적으로 증가하여 종양을 형성하게 된다. 즉, 종양의 성장은 세포생산과 세포죽음 사이의 불균형으로 인해 생긴 결과라고 말할 수 있다. 이처럼 세포 생존 주기는 인간이 정상적인 유기체를 유지하는데에 정말 중요한 영향을 미친다. 그래서, 실험할 때 세포가 죽었는지 살았는지, 죽어가는 단계 중에서도 어떤 단계인지를 확인하는 실험들이 많이 있다. 이렇게 세포 주기를 확인하기 위해 여러 파라미터들이 있다!! 세포가 죽을 때는 apoptosis를 거치게 되는데, apoptosis는 세포사(死)의 한 형태로 외부 인자의 자극이나 내적인 변화에 의해 세포사경로가.. 2020. 10. 14.
[암] HER2 란 무엇일까? 검증 방법과 표적 항암제는? HER2 란 무엇일까? HER2 의 다른 별명은 ERBB2, CD340, HER2/neu, MLN19, NEU, NGL, TKR1, erb-b2 receptor tyrosine kinase 2가 있다. HER2는 human epidermal growth factor receptor (HER/EGFR/ERBB) 계열의 구성원이다. 이 유전자의 증폭과 과발현 되는 것은 유방암의 발생과 진행에 중요한 역할을 하는 것으로 나타났다. HER2 단백질은 유방암 환자의 약 30%에게 중요한 바이오마커이자 치료의 표적이 된다. HER2는 HER1과 유사한 구조를 가지고 있어서 그렇게 명명되었다. Neu는 신경종양의 일종인 Glioblastoma세포주에서 유래되어서 그렇게 명명되었다. ERBB2는 나중에 EGFR을 코딩.. 2020. 10. 10.